代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
物质检验：消化吸收组学枝术要对中医中的普通机械物质完成多方面分折，检验出药草中的活力性物质。比如说，合理利用源于质谱（MS）的消化吸收组学枝术，不错检验出西洋参中的西洋参皂苷等活力性物质。这款枝术还不错分别中成药和非中成药区域的普通机械标签物，为中医的产品品质把握供应合理性。
性能水平把控好：能够 分解分解分解组学工艺，能能对中成药的性能水平使用监测和把控好。譬如，再生利用蕨类草本植物分解分解分解组学分析一下，能能搭建重要性类风湿病性髋风湿病的中成药组成的性能水平标签的物理发光法工艺。还有就是，分解分解分解组学还能能识別中成药中的毒素组成以至于毒素系统，如能够 UPLC-Q-TOF-MS钻研，面部识别各种乌头蕨类草本植物的物理组成，并识別体现了止痛活力性和发生急性毒素的生物技术碱。
2. 中药药效机制研究
能力靶点判别：新陈代谢组学技術可不可以关心判别中草药活性酶类成份的氧分子靶点。随后，钻研找到雷公藤红素可完成调整Treg/TH1和Treg/Th17发展、阻绝NF-κB环路等长效机制更好地发挥免疫抑制能力。
用系统解读：分解率率组学能力够阐明成药医疗肠道疾病的用系统。举例，设计概述知道青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体分解率率增加光于，非靶向治疗分解率率组学阐明了与该全过程对应的分解率率物不同。不仅如此，分解率率组学还能否能够 概述分解率率物的不同，设计概述成药复方的用系统。
3. 中药安全性评价
毒副作用机理科研：分解组学技术性能能使用科研中成药的毒副作用机理。列如，依据分解组学和16S rDNA测序的优化组合具体分析，阐释了清益汤对病情比较重的时候慢性膀胱胰腺炎关于慢性膀胱肺磨损的保护英文机理，并决定了铁沉着冷静、差异性分解物和枯草芽孢杆菌学菌群左右的的关系。
稳定性鉴定：排泄组学技木还可不可以用做草药的稳定性鉴定，辨识潜在性的的毒素化学物质和毒素靶点，所以为草药的稳定安全使用出具专业法律依据。
4. 中医证候研究
证候各种涉及到内容基础代谢率率转化物深入分析：基础代谢率率转化组学技能不错中用的研究方法与中医妇科药证候各种涉及到内容的内源性基础代谢率率转化物变迁，辅佐中医妇科药证候的判断和预防。列如 ，按照基础代谢率率转化组学的研究，已在冠相思病女性中评定出与痰瘀证和气流阴两虚证各种涉及到内容的微生物标志的意思物。
证候行为矫正进行分析：消化吸收组学方法应用还可不可以主要中用进行分析中药方对中医理论证候的行为矫正视觉效果。列举，经由消化吸收组学方法应用及聚类算法进行分析法，察觉到“黄芪-茯苓-泽泻”等有关用药加装适主要中用肾病总体征的新组方用药，会对很多种肾病总体征相关内容的生物体符号物引起应响。
5. 多组学技术整合应用
多个学组合：分解代谢组学与另外组学技术软件广泛应用（如什么是基因组学、转录组学、核高蛋白组学等）的组合软件广泛应用，为中葯茶研究研究分析出示没事个多向度的研究分析体系结构。此种组合软件广泛应用实际上加剧了我们的对中葯茶材料在碳原子这方面上对人体人体生理特点和疾病情况的后果，有时为表明中葯茶的的作用机理和疗效产物基础条件出示了强有劲的平台。
问题调理长效工作机制：多个学技巧可能中用实验中草药调理问题的碳原子长效工作机制。比如说，使用淀粉酶质组学和分解分泌组学的联合技术适用，折射出了与中医医生划分的膝髋骨关节骨性髋骨骨关节炎重视有关的的差别表明淀粉酶和分解分泌环路。
产生组学技木在西药实验中的使用，为西药的现在化和精准性的医疗器械展示了最重要的完美支技，有利于促进推动了西药的要求化和时代专业化快速发展。