
近日,上海医科高校一号附屬卫生院王学浩科学院院士创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗能源产生检测分析服务。
因为一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文微信标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主院校:南京医科大学
研发装修材料:细胞
拜谱带来保障:转录组测序+核蛋白互作组+靶向药物正能量分解组
水平路线规划:
探析的结果
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的至关重要人类基因
本研究浅析采样HCC肿癌样表(n=7)的单癌血癌细胞RNA测序数据表格报告集开始浅析,显示糖酵解灵活性通常网络化在肿癌癌血癌细胞中,hdWGCNA浅析辨别的出9个遗传基因接口(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的荒岛我的世界生存浅析设定YBX1为自己荒岛我的世界生存的风险基本要素(图1H)。进每一步紧密联系IHC、WB实验设计和肿癌组建机构与相临非肿癌组建机构的三维空间转录组学数据表格报告集查证YBX1是肝癌血癌细胞癌治愈的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被决定为设定HCC肿瘤细胞糖酵解的关健客观因素
02、YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物正能量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1通过并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1综合并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化减弱其磷酸性反应,得以加快其核转位
进每每一步检查YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以关系其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC内部中或用OGT抑制性剂OSMI-1正确处里,YBX1淀粉酶级别差异性有效降低,YBX1磷酸性反应差异性避免(图4A-C)。IP实验室提示 ,在想同的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷酸性反应级别差异性高出YBX1-T57A,说明磷酸性反应的加强不只有仅是担心比较高的YBX1淀粉酶展现(图4D)。分离法了核和质混合物发展TMG正确处里的HCC内部中YBX1核展现的增加(图4E-F),进每每一步发展YBX1磷酸性反应的核心调接成分是AKT(图4G-I)。这类发展特别强调O-GlcNAc糖基化经过驱动其磷酸性反应来加强YBX1淀粉酶动态平衡性并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有帮助于其进一部时有发生磷碱化淡化并够加快其核转位
05、YBX1有助于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1力促PKM2转录
06、YBX1 才能提高自己组蛋白酶乳酸性反应呈现水平方向
分析得知YBX1敲低差异性消减淀粉酶质乳过酸,特别的是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的实验性得知了糖酵解与组淀粉酶乳过酸的进行性连接,促使糖酵解可差异性消减H3K18la品质(图6D)。PKM2过表明可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la减少,以外源乳酸净化处理不只是大幅提升H3K18la,还伴YBX1表明上涨,显示信息普遍存在同向返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la顺利通过生物富集于YBX1启动时子进行性有助于其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化调空(图6H-J),并得知P300 上涨是YBX1开展H3K18乳酰化为用的管理机制(图6K-L)。
图6.YBX1促进H3K18乳硝化作用绘制平行
文章标题总结ppt
在此项分析中新闻报道了YBX1在HCC中高表示,还与糖酵解秘切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,为了平稳淀粉酶质并增大其表示。这些装饰还推进YBX1在T57处的磷碱化,推进其核易位。由此,某些环节提高了糖酵解一些染色体遗传的转录并促使乳酸的生成。最后,YBX1刺激启动P300的转录,继而动力组淀粉酶的乳碱化,格外是H3K18la,H3K18乳碱化朝宏观调控YBX1染色体遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传的双面馈环措施图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法精力新陈代谢组技术服务,拜谱怪物建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、翻译专业后绘制组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
可以参考专著
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.